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由塔爾圖??大學(xué)牽頭的研發(fā)中心將把合成生物學(xué)與數(shù)字技術(shù)相結(jié)合,促進(jìn)生物產(chǎn)業(yè)細(xì)胞的大數(shù)據(jù)驅(qū)動設(shè)計(jì),促進(jìn)基于工業(yè)生物技術(shù)的研究和新業(yè)務(wù)的發(fā)展。該中心與塔林科技大學(xué)和丹麥技術(shù)大學(xué)合作開發(fā),從歐盟委員會獲得了 1500 萬歐元,愛沙尼亞政府還投資了 1500 萬歐元。
根據(jù)塔爾圖大學(xué)分子系統(tǒng)生物學(xué)教授兼DigiBio聯(lián)盟負(fù)責(zé)人 Mart Loog 的說法,收集生物數(shù)據(jù)的現(xiàn)代技術(shù)能力增加了數(shù)據(jù)量,其速度比研究中分析和使用的速度快很多倍。例如,此類大數(shù)據(jù)包括基因組序列或基因組工程和合成數(shù)據(jù)。合成生物學(xué)(SynBio) 是一個多學(xué)科研究領(lǐng)域,旨在創(chuàng)造新的生物部件、設(shè)備和系統(tǒng),或重新設(shè)計(jì)已經(jīng)在自然界中發(fā)現(xiàn)的系統(tǒng)。例如,微生物被重新設(shè)計(jì)以生產(chǎn)化學(xué)品和生物材料,以幫助我們打破對石化產(chǎn)品的依賴。“為了在該領(lǐng)域和生物工業(yè)的研究中實(shí)現(xiàn)質(zhì)量飛躍,我們需要通過將產(chǎn)生大數(shù)據(jù)的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)與可以處理大數(shù)據(jù)、從中學(xué)習(xí)并為新細(xì)胞創(chuàng)建設(shè)計(jì)的 IT 工具相結(jié)合來加速細(xì)胞設(shè)計(jì), "洛格解釋道。
這正是升級愛沙尼亞生物可持續(xù)性中心的目標(biāo)。用于構(gòu)建細(xì)胞系統(tǒng)的數(shù)字化和機(jī)器人輔助實(shí)驗(yàn)室單元——生物鑄造廠– 將建立并鏈接到軟件開發(fā)、大數(shù)據(jù)處理和機(jī)器學(xué)習(xí)的 IT 部門。根據(jù) Loog 的說法,生物系統(tǒng)的設(shè)計(jì)類似于所有工程,它使用設(shè)計(jì)-構(gòu)建-測試-學(xué)習(xí) (DBTL) 循環(huán)。例如,通過將廢氣供給經(jīng)過特殊改造的產(chǎn)乙酸細(xì)菌,可以生產(chǎn)燃料或其他對化學(xué)工業(yè)必不可少的原料。到目前為止,提高這些細(xì)菌的生產(chǎn)力需要人工創(chuàng)造或?qū)ふ液线m的基因突變。數(shù)字化將使機(jī)器學(xué)習(xí)能夠找到最佳組合,并更快、更高效地從生物數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)并基于這些數(shù)據(jù)創(chuàng)建優(yōu)質(zhì)細(xì)胞。“這基本上是一種高度加速的生物進(jìn)化,通過 IT 和工程周期的合理設(shè)計(jì)得到加強(qiáng),
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